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虾虹彩病毒探针法荧光定量PCR试剂盒

人阅读 发布时间:2023-11-29 08:19

虹彩病毒科宿主范围广泛,可感染脊椎动物和无脊椎动物,它们在水生物种中广泛分布,可能导致大规模损失。它可感染四脊滑螯虾(Cherax quadricarinatus)、凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)、罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)、日本沼虾(Macrobrachium nipponense)、克氏原螯虾(Procambarus clarkii)、脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)、中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)和粗腿厚纹蟹(Pachygrapsus crassipes)等。本产品就是以探针法荧光定量PCR技术为基础开发的专门检测虾虹彩病毒的试剂盒,它具有下列特点:
  1. 即开即用,用户只需要提供样品DNA模板。
  2. 引物和探针经过优化,灵敏性高
  3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
  4. 特异性高,引物是根据虾虹彩病毒DNA高度保守区设计,不会跟其他微生物的DNA发生交叉反应。
  5. 既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量级。
  6. 本产品足够50次20μL体系的探针法荧光定量PCR反应。
  7. 本产品只能用于科研
 
编号
A 190303
B 180701
C 100935
D 15-75430yp
E 75430pc
使用手册 15-75430sc
 
低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。  
样品DNA  
一、稀释标准曲线样品(以10E1-10E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
  1. 标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。
  2. 用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同
  3. 6号管中加入5 μL 10E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得10E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
  4. 换枪头,在5号管中加入5 μL 10E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得10E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
  5. 换枪头,在4号管中加入5 μL 10E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得10E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
  6. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品DNA的制备
  1. 如果有N个样品待提取最好设置N+2个提取,多出的是PC(样品制备阳性对照)和NC样品制备阴性对照)。可以取阳性对照的1000倍稀释液10μL再加上一定量的水,使总体积与待提取样品的规定体积一致,以此作为PC另外用水作为NC。
  2. 用自选方法纯化样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容。
三、Probe qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行
  1. 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个于上步得到的N+2个样品1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个于上步得到的N+2个样品1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR性对照(用第4号管的阳性对照稀释液做模板)下面只以定量分析为例描述操作步骤
  2. 标记管中下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖子储存后最后加):
成分/每管 样品管
N+2
PCR阴性对照管 标准曲线
样品管(1-6管)
A 10 μL 10 μL 10 μL
D 3 μL 3 μL 3 μL
 N+2个待测DNA模板 7 μL - -
C - 7 μL -
6所得标准曲线样品稀释液(1-6 - - 7 μL(1号样到1号管,2号样到2号管
  1. 盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
过程 温度 时间
预变性 95 10 min
PCR反应
45个循环)
95 15 sec
60 60 sec(采集FAM通道的荧光信号
数据处理
  1. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品核酸浓度的log值,推算出其浓度
  2. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于39。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于39则为阳性。如果在39-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。
 

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