羊膜干细胞是从新生胎儿羊膜上分离得到的干细胞，它来源丰富、分离过程简单、无伦理限制、细胞增殖能力强、多向分化潜能、体内体外无致瘤作用、低免疫原性、免疫调节、造血支持及可透过血脑屏障等优势。

       羊膜干细胞的表面标志物表达和骨髓间充质干细胞类似，有间充质干细胞表面标志物CD90、CD105、CD166、SH3和SH4（CD73）；表达整合素家族（CD29、CD49b、CD49c、CD49e、CD49d）的成员；羊膜干细胞还表达胚胎干细胞类的表面标志物Oct-3/4、SSEA-3，SSEA-4，这些因子的阳性表达说明羊膜干细胞可能是介于胚胎干细胞和成体干细胞之间的一个中间等级的干细胞，而这些胚胎干细胞因子在骨髓间充质干细胞中不表达，因此羊膜干细胞的增殖能力比骨髓间充质干细胞更强。
       羊膜干细胞表达黏附分子CD44，但不表达造血干细胞标志物CD34、CD45、CD117、CD56、CD133、Fh-1。羊膜干细胞不表达免疫因子HLA-DR、CD14，弱表达HLA-ABC，也不表达共刺激分子cD80、cD86、CD40L等，表明羊膜干细胞的免疫原性很低，这在干细胞移植中具有重要意义。
       羊膜干细胞在体外可分化为心肌细胞、胰岛β细胞、肝脏细胞、骨细胞、软骨细胞、脂肪细胞及神经元等来自三个不同胚层的细胞，而这些细胞免疫原性极低，表明进行组织细胞移植时不容易发生排斥反应。同时，羊膜干细胞可分泌大量的细胞因子，通过旁分泌作用达到抑制炎症、参与免疫调节的功效。
       此外，羊膜干细胞的分化潜能基本上可以与胚胎干细胞相媲美，但其无伦理障碍，无致瘤作用及低免疫原性是其优点。因此，鉴于羊膜干细胞及其干细胞因子在治疗诸多临床疾病如糖尿病、急性肝损伤、肺损伤、脑中风、阿尔茨海默症、纤维化类疾病、视网膜黄斑病变、卵巢早衰症及肿瘤等疾病方面具有显著的疗效，羊膜干细胞可称为是干细胞家族中的佼佼者。